Кроме dotnet, остальные библиотеки являются стандартными и Dying Light: The Beast запускается только с ними.
Включение остальных библиотек необходимо расматривать для каждой игры отдельно согласно PortProtonDB или подбирать.
После обновления PortProton пробовали Сброс настроек PortProton для конкретной игры или приложения?