После создания ярлыка есть возможность отключения всплывающих окон PortProton при запуске с ярлыка.
Для этого нужно перейти при запуске приложения перейти в (1) НАСТРОЙКИ, затем в (2) Основные настройки:
В открывшемся меню нужно найти (3) GUI DISABLED CS
При этом при запуске игры из главного окна PortProton всё равно будут доступны данные всплывающие окна, для возможности внесения изменений в настройки.

