В случае наличия проблем с работой PortProton (сначала ознакомьтесь c менее радикальным способом), обычно его достаточно просто переустановить. Чтобы это сделать не требуется удалять и заново устанавливать пакет PortProton. Предусмотрена возможность переустановки непосредственно из приложения, при этом ваши игры и сохранения не удаляются.
Переустановка в графическом интерфейсе
Переходим в НАСТРОЙКИ PORTPROTON (1) и найти там кнопку Переустановить PORTPROTON (2) и нажать её
Подтвердить своё намерение переустановить PortProton.
После чего начнётся загрузка файлов для переустановки. Когда загрузка файлов завершится, откроется приложения.
Переустановка из эмулятора терминала
Так же есть способ переустановки PortProton, если нет возможности его открыть, то в консоли пишем:
portproton --reinstall
По всем вопросам связанным с работой PortProton можно обратиться в тему на форуме LINUX-GAMING.RU (в случае проблем приложить файл лога)